Hi there,<div><br></div><div>I have an script in ipython with things like:</div><div><br></div><div><div>    head = !grep &#39;^&gt;&#39; ${tax}*.fasta</div><div>    gen = [line.split()[1].split(&#39;:&#39;)[1] for line in head]</div>

<div><br></div><div>But if doing in bash terminal:</div><div><br></div><div>&gt; ipython myscript.py</div><div><br></div><div>I got this error:</div><div><br></div><div><div>   File &quot;myscript.py&quot;, line 85</div>
<div>
     head = !grep &#39;^&gt;&#39; ${tax}*.fasta</div><div>            ^</div><div>SyntaxError: invalid syntax</div><div><br></div><div>WARNING: Failure executing file: &lt;myscript.py&gt;</div></div><div><br></div><div>How to go around it?</div>

<div><br></div>Many thanks in advance,</div><div><br></div><div>Alan<br>-- <br>Alan Wilter SOUSA da SILVA, D.Sc.<div>Bioinformatician, UniProt - PANDA, EBI-EMBL<br>CB10 1SD, Hinxton, Cambridge, UK</div><div>+44 1223 49 4588</div>

<br>
</div>