I&#39;ve had this problem in ubuntu as well. As Fernando said when you create a shortcut it inherits nothing from your environment. The work around I&#39;ve come up with is to define the command as<br><br>sh -c &quot;export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/path/to/local/python/scripts/; /usr/local/bin/ipython notebook --pylab inline&quot;<br>

<br>Ben<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jan 27, 2012 at 6:16 AM, Angus McMorland <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:amcmorl@gmail.com">amcmorl@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

2012/1/27 Fernando Perez &lt;<a href="mailto:fperez.net@gmail.com">fperez.net@gmail.com</a>&gt;:<br>
<div class="im">&gt; 2012/1/27 Zoltán Vörös &lt;<a href="mailto:zvoros@gmail.com">zvoros@gmail.com</a>&gt;:<br>
&gt;&gt; when I put this into the menus, it fails for some reason.<br>
&gt;<br>
&gt; This was the key piece of information you hadn&#39;t told us!  I was<br>
&gt; assuming you were starting it from the cmd line...<br>
&gt;<br>
&gt; In general, anything you start from a  menu/gui launcher does NOT<br>
&gt; inherit your environment.  You can see that by simply making a<br>
&gt; launcher that calls a shell script that does<br>
&gt;<br>
&gt; env &gt; ~/env.txt<br>
&gt;<br>
&gt; and you&#39;ll see an environment without your personal variables.<br>
&gt;<br>
&gt; I think there&#39;s a way to set the env. so it&#39;s inherited by gui<br>
&gt; launchers too, but I&#39;ve never bothered to find out the details.  I<br>
&gt; just keep Tilda on call at F12 and start everything from it.<br>
<br>
</div>Assuming you&#39;re using standard Ubuntu (i.e. gnome-based), I think you<br>
want to define environment variables for the current session into<br>
.gnomerc in your home directory (create the file if it doesn&#39;t already<br>
exist). From there they get set for the current gnome session.<br>
<br>
Angus<br>
<div class="im HOEnZb"><br>
&gt; Cheers,<br>
&gt;<br>
&gt; f<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; IPython-User mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:IPython-User@scipy.org">IPython-User@scipy.org</a><br>
&gt; <a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user" target="_blank">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user</a><br>
<br>
<br>
<br>
</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">--<br>
AJC McMorland<br>
Post-doctoral research fellow<br>
Neurobiology, University of Pittsburgh<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5">_______________________________________________<br>
IPython-User mailing list<br>
<a href="mailto:IPython-User@scipy.org">IPython-User@scipy.org</a><br>
<a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user" target="_blank">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>