The SGE issue is fixed in master, and a workaround is described in <a href="https://github.com/ipython/ipython/issues/2171">Issue #2171</a>.<br><br>On Tue, Jul 24, 2012 at 5:44 PM, Robert Nishihara &lt;<a href="mailto:robertnishihara@gmail.com">robertnishihara@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>

&gt; &lt;<a href="http://lists.ipython.scipy.org/pipermail/ipython-user/2012-July/010619.html">http://lists.ipython.scipy.org/pipermail/ipython-user/2012-July/010619.html</a>&gt;<br>&gt; for reference.<br>&gt;<br>&gt;<br>

&gt; On Tue, Jul 24, 2012 at 5:42 PM, Robert Nishihara<br>&gt; &lt;<a href="mailto:robertnishihara@gmail.com">robertnishihara@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; I am also interested in the answer to this question.<br>

&gt;&gt;<br>&gt;&gt; I think I am running into the same problem (except I am using SGE) when I<br>&gt;&gt; use IPython 0.13. It works in IPython 0.12. <br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; On Thu, Jul 19, 2012 at 1:39 AM, M. Wimmer &lt;<a href="mailto:wimmer.mike@gmail.com">wimmer.mike@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>

&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; Thanks for the quick reply!<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt; (or similar)PR #2163 (one-character patch) should fix it.  Can you<br>&gt;&gt;&gt; &gt; confirm<br>&gt;&gt;&gt; &gt; that?<br>
&gt;&gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; I tried this, and it certainly fixes the problem with the profile<br>&gt;&gt;&gt; directory<br>&gt;&gt;&gt; (i.e. the scp-commands work now).<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; However I have still problems with the engines not being launched due to<br>

&gt;&gt;&gt; a<br>&gt;&gt;&gt; syntax error (only the relevant part, and I add -vvv to ssh):<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; 2012-07-19 10:29:34.700 [IPClusterStart] debug1: Sending command:<br>&gt;&gt;&gt;  /usr/bin/python -c from IPython.parallel.apps.ipengineapp import<br>

&gt;&gt;&gt;  launch_new_instance; launch_new_instance() --profile-dir<br>&gt;&gt;&gt;  .ipython/profile_ssh --log-to-file --log-level=20<br>&gt;&gt;&gt; 2012-07-19 10:29:34.763 [IPClusterStart] bash: -c: line 0: syntax error<br>

&gt;&gt;&gt; near<br>&gt;&gt;&gt;  unexpected token `--profile-dir&#39;<br>&gt;&gt;&gt; 2012-07-19 10:29:34.764 [IPClusterStart] bash: -c: line 0:<br>&gt;&gt;&gt; `/usr/bin/python<br>&gt;&gt;&gt;  -c from IPython.parallel.apps.ipengineapp import launch_new_instance;<br>

&gt;&gt;&gt;  launch_new_instance() --profile-dir .ipython/profile_ssh --log-to-file<br>&gt;&gt;&gt;  --log-level=20&#39;<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; It seems to me that there are some quotation marks missing around `from<br>

&gt;&gt;&gt; ...<br>&gt;&gt;&gt; launch_new_instance()`? (I have to admit that quoting always confuses me)<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; Indeed, if I add to ipcluster_config.py<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt;  c.SSHEngineSetLauncher.engine_cmd = [&#39;/usr/bin/python&#39;, &#39;-c&#39;, &#39;\&quot;from<br>

&gt;&gt;&gt;   IPython.parallel.apps.ipengineapp import launch_new_instance;<br>&gt;&gt;&gt;   launch_new_instance()\&quot;&#39;]<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; the syntax error is solved.<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; Unfortunately, the cluster still does not start, as the engines simply<br>

&gt;&gt;&gt; stop<br>&gt;&gt;&gt; within two seconds or so. I&#39;m still investigating this, but in any case<br>&gt;&gt;&gt; it<br>&gt;&gt;&gt; would be nice if you could have a look into what I wrote above.<br>&gt;&gt;&gt;<br>

&gt;&gt;&gt; All the best,<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; Michael<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; _______________________________________________<br>&gt;&gt;&gt; IPython-User mailing list<br>&gt;&gt;&gt; <a href="mailto:IPython-User@scipy.org">IPython-User@scipy.org</a><br>

&gt;&gt;&gt; <a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user</a><br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt; _______________________________________________<br>

&gt; IPython-User mailing list<br>&gt; <a href="mailto:IPython-User@scipy.org">IPython-User@scipy.org</a><br>&gt; <a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/ipython-user</a><br>

&gt;<br><br>