While installing numpy under a non-conventional directory:<br>
&nbsp;<b>python setup.py install --prefix==/gpfs1/active/jose/code/python<br>
</b>I get two classes of warnings:<br>
<br>
<span style="font-weight: bold;">(1) </span>blas_mkl_info:<br>
/tmp/numpy-0.9.5/numpy/distutils/system_info.py:531: UserWarning: Library error: libs=['mkl', 'vml', 'guide'] found_libs=[]<br>
&nbsp; warnings.warn(&quot;Library error: libs=%s found_libs=%s&quot; % \<br>
&nbsp; NOT AVAILABLE<br>
(and others warnings similar to this)<br>
<br>
<span style="font-weight: bold;">(2)</span>numpy.core - nothing done
with h_files= ['build/src/numpy/core/src/scalartypes.inc',
'build/src/numpy/core/src/arraytypes.inc',
'build/src/numpy/core/config.h',
'build/src/numpy/core/__multiarray_api.h']<br clear="all">
(and others warnings similar to this)<br>
<br>
I created a very simple <span style="font-weight: bold;">site.cfg </span>file under <span style="font-weight: bold;">numpy/distutils</span>, which goes like this<br>
[blas]<br>
library_dirs = /usr/lib64<br>
[lapack]<br>
library_dirs = /usr/lib64<br>
<br>
I have no Atlas library installed in the system.<br>
My compiler: gcc version 3.4.4 20050721 (Red Hat 3.4.4-2)&nbsp; (I also have <span style="font-weight: bold;">pg </span>compilers)<br>
<br>
After setup.py has run, I have no <b>/gpfs1/active/jose/code/python/lib64/python2.3/site-packages/numpy </b>created. So numpy is not installed.<br>
Any ideas, please?<br>-- <br>Jose M. Borreguero<br><a href="mailto:jmborr@gatech.edu">jmborr@gatech.edu</a>,&nbsp;&nbsp;<a href="http://www.borreguero.com">www.borreguero.com</a><br>phone: 404 407 8980 Fax: 404 385 7478<br>Center for the Study of Systems Biology,
<br>School of Biology,<br>Georgia Institute of Technology,<br>250 14St NW,<br>Atlanta GA 30318