<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Mar 16, 2010 at 1:04 AM, Vincent Davis <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:vincent@vincentdavis.net">vincent@vincentdavis.net</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
I have an array 10 observations of 230,000 variables and what to find the correlation coefficient between each variable.<div>numpy.corrcef(data) works except I can only do it with about 30,000 variables at a time. numpy.corrcef(data[:30000]). It uses up a lot of memory.</div>

<div>Is there a better way?</div></blockquote><div><br><br>how much memory does a <br>&gt;&gt;&gt; 230000**2<br>52900000000L<br><br>float (double) array take ?<br><br>Josef<br>(I&#39;m not going to try)<br><br> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<div><br><div name="mailplane_signature"> <table><tbody><tr><td width="80">
<img src="">
</td><td width="10"></td><td align="center" width="127">
<div style="padding: 5px; font-size: 11px; color: rgb(102, 102, 102);">
  <p><b>Vincent Davis<br>
    720-301-3003
  </b><br>
    
    <a href="mailto:vincent@vincentdavis.net" target="_blank">vincent@vincentdavis.net</a>  </p>
<div style="font-size: 10px;">
  <a href="http://vincentdavis.net" target="_blank">my blog</a> |
  <a href="http://www.linkedin.com/in/vincentdavis" target="_blank">LinkedIn</a></div></div></td></tr><tr></tr></tbody></table></div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>
SciPy-User mailing list<br>
<a href="mailto:SciPy-User@scipy.org">SciPy-User@scipy.org</a><br>
<a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/scipy-user" target="_blank">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/scipy-user</a><br>
<br></blockquote></div><br>